看你用什么系統來查重了，如果用知網查重cnkivip.net來檢測的話建議不要刪除參考文獻，不過只要格式對的話知網查重也不會去查重參考文獻的。

標題、目錄、作者信息不提交，僅提交摘要、關鍵詞、正文和參考文獻，避免干擾檢測結果。

最主要是你選擇的論文查重系統看吧，用不同的查重系統所查重的不一樣。

PaperRight論文查重系統的查重提交是需要將參考文獻的提交查重的，查重這樣會更加精準的，而且在PaperRight論文查重中可以精準的查重到你的參考文獻的引用地方